Jeżeli uważasz, że poniższy komentarz powinien zostać usunięty, wypełnij formularz

Ten film to manipulacja. 18-bp sekwencja będzie często miała odpowiednik w genomie. W PCR liczy się specyficzność pary primerów. Tutaj jeszcze dochodzi dodatkowa specyficzność od sondy. Każdy może pójść na stronę: genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgPcr i wklepać sekwenjce primerów ATGAGCTTAGTCCTGTTG CTCCCTTTGTTGTGTTGT i zobaczyć czy coś wyjdzie: UCSC In-Silico PCR No matches to atgagcttagtcctgttg ctccctttgttgtgttgt in Human Dec. 2013 (GRCh38/hg38) Primer Melting Temperatures Forward: 48.0 C atgagcttagtcctgttg Reverse: 51.4 C ctccctttgttgtgttgt The temperature calculations are done assuming 50 mM salt and 50 nM annealing oligo concentration. The code to calculate the melting temp comes from Primer3. Chodzi o to że w PCR oba primery muszą się wiązać dobrze, w odpowiedniej orientacji względem siebie i blisko siebie. dla RT-qPCR to musi być <1000 bp żeby dawało fałszywy sygnału (albo i mniej zależy od odczynników i maszyny) Pomijam dodatkowo fakty, że używa się RNA nie DNA, więc obszar genomu może nawet nie być transkrybowany i w rzeczy samej wygląda, że nie jest.